Anthropic сообщила, что Claude самостоятельно провёл вычислительные кампании по созданию белковых мини-связывателей. Это небольшие белки, которые прикрепляются к заданным молекулам. Полученные конструкции синтезировали и проверили в физических экспериментах две независимые лаборатории — Adaptyv Bio и Twist Bioscience.
Claude не создавал белки силами одной языковой модели. Агент управлял набором специализированных инструментов: выбирал участки белков-мишеней, запускал генераторы структур и последовательностей, отсеивал кандидатов, проводил оптимизацию и составлял итоговый рейтинг.
Люди заранее выбрали мишени, предоставили подробный протокол, вычислительные ресурсы и инфраструктуру. После запуска кампаний они не давали научных подсказок и не редактировали последовательности перед отправкой в лаборатории.
В итоговый анализ вошли 1320 конструкций для 15 мишеней. Связывание подтвердилось у 354 вариантов — это 26,8%. Хотя бы один рабочий мини-связыватель получили для 14 мишеней.
Результаты сильно зависели от выбранного белка. Для TREM2 сработали 72 конструкции из 90, для VEGF-A — 54 из 90, для IL-7Rα — 49 из 90. Для мальтозосвязывающего белка не сработала ни одна из 90 конструкций.
По данным Anthropic, у 194 связывателей константа диссоциации оказалась ниже 100 нМ, у 90 — ниже 10 нМ, а у 42 — ниже 1 нМ. Чем меньше это значение, тем прочнее обычно связываются молекулы.
Лаборатории независимо измерили 1235 одинаковых конструкций. Их основные выводы совпали в 89% случаев. Данные, промпты, расчётные структуры и история экспериментов опубликованы в открытом репозитории.
Работа пока представлена как исследование Anthropic, а не как рецензированная научная публикация. Экспериментальные структуры комплексов не определялись, а мини-связыватели не проходили проверки безопасности и эффективности как лекарства. Claude автоматизировал раннюю стадию белкового дизайна — до готового препарата ещё далеко.
